The distribution of coastal fish eDNA sequences in the Anthropocene
Laetitia Mathon
(1)
,
Virginie Marques
(1)
,
Stéphanie Manel
(1)
,
Camille Albouy
(2)
,
Marco Andrello
(3, 4)
,
Emilie Boulanger
(5)
,
Julie Deter
(6, 3)
,
Régis Hocdé
(3)
,
Fabien Leprieur
(7, 8, 3, 9)
,
Tom Letessier
(10, 11)
,
Nicolas Loiseau
(3)
,
Eva Maire
(12)
,
Alice Valentini
(13)
,
Laurent Vigliola
(14)
,
Florian Baletaud
(3, 15)
,
Sandra Bessudo
(16)
,
Tony Dejean
(13)
,
Nadia Faure
(1)
,
Pierre‐edouard Guerin
(1)
,
Meret Jucker
(17)
,
Jean‐baptiste Juhel
(3)
,
K. Kadarusman
(18)
,
Andrea Polanco F.
(19)
,
Laurent Pouyaud
(20)
,
Dario Schwörer
,
Kirsten Thompson
(21, 22)
,
Marc Troussellier
(23)
,
Hagi Yulia Sugeha
(24)
,
Laure Velez
(3)
,
Xiaowei Zhang
(25)
,
Wenjun Zhong
(26)
,
Loïc Pellissier
(27)
,
David Mouillot
(3)
1
CEFE -
Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive
2 DECOD - Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l’océan
3 UMR MARBEC - MARine Biodiversity Exploitation and Conservation - MARBEC
4 IAS - Institute for the Study of the Anthropic Impacts and the Sustainability in the Marine Environment
5 MIO - Institut méditerranéen d'océanologie
6 Andromède Océanologie
7 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
8 IFREMER - Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer
9 IRD [France-Ouest] - Institut de Recherche pour le Développement
10 Zoological Society of London
11 UWA - The University of Western Australia
12 Lancaster Environment Centre
13 SPYGEN [Le Bourget-du-Lac]
14 ENTROPIE [Réunion] - Ecologie marine tropicale dans les Océans Pacifique et Indien
15 ENTROPIE [Nouvelle-Calédonie] - Ecologie marine tropicale des océans Pacifique et Indien
16 Fundación Malpelo y Otros Ecosistemas Marinos
17 ITES - Institute of Terrestrial Ecosystems
18 POLTEK - Politeknik Kelautan dan Perikanan Sorong
19 Programa de Biodiversidad y Ecosistemas Marino
20 UMR ISEM - Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier
21 University of Exeter
22 Greenpeace Research Laboratories
23 ECOLAG - Ecosystèmes lagunaires : organisation biologique et fonctionnement
24 UI - Universitas Indonesia
25 Centre of Chemical Safety and Risks, School of the Environment, Nanjing University
26 NJU - Nanjing University
27 Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research WSL
2 DECOD - Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l’océan
3 UMR MARBEC - MARine Biodiversity Exploitation and Conservation - MARBEC
4 IAS - Institute for the Study of the Anthropic Impacts and the Sustainability in the Marine Environment
5 MIO - Institut méditerranéen d'océanologie
6 Andromède Océanologie
7 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
8 IFREMER - Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer
9 IRD [France-Ouest] - Institut de Recherche pour le Développement
10 Zoological Society of London
11 UWA - The University of Western Australia
12 Lancaster Environment Centre
13 SPYGEN [Le Bourget-du-Lac]
14 ENTROPIE [Réunion] - Ecologie marine tropicale dans les Océans Pacifique et Indien
15 ENTROPIE [Nouvelle-Calédonie] - Ecologie marine tropicale des océans Pacifique et Indien
16 Fundación Malpelo y Otros Ecosistemas Marinos
17 ITES - Institute of Terrestrial Ecosystems
18 POLTEK - Politeknik Kelautan dan Perikanan Sorong
19 Programa de Biodiversidad y Ecosistemas Marino
20 UMR ISEM - Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier
21 University of Exeter
22 Greenpeace Research Laboratories
23 ECOLAG - Ecosystèmes lagunaires : organisation biologique et fonctionnement
24 UI - Universitas Indonesia
25 Centre of Chemical Safety and Risks, School of the Environment, Nanjing University
26 NJU - Nanjing University
27 Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research WSL
Laetitia Mathon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1177384
- ORCID : 0000-0001-8147-8177
Virginie Marques
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1177114
- ORCID : 0000-0002-5142-4191
Stéphanie Manel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1177151
- ORCID : 0000-0001-8902-6052
Camille Albouy
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1179484
- ORCID : 0000-0003-1629-2389
- IdRef : 166692131
Marco Andrello
- Fonction : Auteur
- PersonId : 778873
- ORCID : 0000-0001-7590-2736
- IdRef : 184433843
Emilie Boulanger
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1200133
- ORCID : 0000-0002-6446-7342
Régis Hocdé
- Fonction : Auteur
- PersonId : 10229
- IdHAL : regis-hocde
- ORCID : 0000-0002-5794-2598
- IdRef : 069469377
Tom Letessier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1250214
- ORCID : 0000-0003-4011-0207
Nicolas Loiseau
- Fonction : Auteur
- PersonId : 754670
- IdHAL : loiseau-nicolas
- ORCID : 0000-0002-2469-1980
Eva Maire
- Fonction : Auteur
- PersonId : 169842
- IdHAL : eva-maire
- ORCID : 0000-0002-1032-3394
- IdRef : 231212720
Alice Valentini
- Fonction : Auteur
- PersonId : 768925
- ORCID : 0000-0001-5829-5479
- IdRef : 131140434
Laurent Vigliola
- Fonction : Auteur
- PersonId : 758721
- ORCID : 0000-0003-4715-7470
- IdRef : 168145979
Tony Dejean
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1177385
- ORCID : 0000-0002-5115-4902
Pierre‐edouard Guerin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 744218
- IdHAL : pierre-edouard-guerin
- ORCID : 0000-0001-7909-3729
Jean‐baptiste Juhel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1177113
- ORCID : 0000-0003-2627-394X
Andrea Polanco F.
- Fonction : Auteur
- PersonId : 823843
- ORCID : 0000-0001-6121-5214
Laurent Pouyaud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1069270
Dario Schwörer
- Fonction : Auteur
Marc Troussellier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1184008
- ORCID : 0000-0003-3890-063X
- IdRef : 033296146
Laure Velez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1266402
- ORCID : 0000-0001-9555-6770
Loïc Pellissier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 802846
- ORCID : 0000-0002-2289-8259
David Mouillot
- Fonction : Auteur
- PersonId : 990344
- ORCID : 0000-0003-0402-2605
- IdRef : 150328400
Résumé
Coastal fishes have a fundamental role in marine ecosystem functioning and contributions to people, but face increasing threats due to climate change, habitat degradation and overexploitation. The extent to which human pressures are impact-ing coastal fish biodiversity in comparison with geographic and environmental factors at large spatial scale is still under scrutiny. Here, we took advantage of environmental DNA (eDNA) metabarcoding to investigate the relationship between fish biodiver-sity, including taxonomic and genetic components, and environmental but also socio- economic factors.
Format du dépôt | Fichier |
---|---|
Type de dépôt | Article dans une revue (article de synthèse) |
Résumé |
en
Coastal fishes have a fundamental role in marine ecosystem functioning and contributions to people, but face increasing threats due to climate change, habitat degradation and overexploitation. The extent to which human pressures are impact-ing coastal fish biodiversity in comparison with geographic and environmental factors at large spatial scale is still under scrutiny. Here, we took advantage of environmental DNA (eDNA) metabarcoding to investigate the relationship between fish biodiver-sity, including taxonomic and genetic components, and environmental but also socio- economic factors.
|
Titre |
en
The distribution of coastal fish eDNA sequences in the Anthropocene
|
Auteur(s) |
Laetitia Mathon
1
, Virginie Marques
1
, Stéphanie Manel
1
, Camille Albouy
2
, Marco Andrello
3, 4
, Emilie Boulanger
5
, Julie Deter
6, 3
, Régis Hocdé
3
, Fabien Leprieur
7, 8, 3, 9
, Tom Letessier
10, 11
, Nicolas Loiseau
3
, Eva Maire
12
, Alice Valentini
13
, Laurent Vigliola
14
, Florian Baletaud
3, 15
, Sandra Bessudo
16
, Tony Dejean
13
, Nadia Faure
1
, Pierre‐edouard Guerin
1
, Meret Jucker
17
, Jean‐baptiste Juhel
3
, K. Kadarusman
18
, Andrea Polanco F.
19
, Laurent Pouyaud
20
, Dario Schwörer
, Kirsten Thompson
21, 22
, Marc Troussellier
23
, Hagi Yulia Sugeha
24
, Laure Velez
3
, Xiaowei Zhang
25
, Wenjun Zhong
26
, Loïc Pellissier
27
, David Mouillot
3
1
CEFE -
Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive
( 1100830 )
- Centre National de la Recherche Scientifique - 1919 route de Mende - 34293 Montpellier CEDEX 5
- France
2
DECOD -
Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l’océan
( 1083968 )
- Institut Agro Rennes Angers, 65 rue de Saint-Brieuc
F-35042 Rennes cedex
- France
3
UMR MARBEC -
MARine Biodiversity Exploitation and Conservation - MARBEC
( 1100742 )
- Université de Montpellier
Bâtiment 24 - CC 093
Place Eugène Bataillon
34095 Montpellier cedex 5 France
- France
4
IAS -
Institute for the Study of the Anthropic Impacts and the Sustainability in the Marine Environment
( 1075799 )
- Italie
5
MIO -
Institut méditerranéen d'océanologie
( 191652 )
- M.I.O. Institut Méditerranéen d'Océanologie
Bâtiment Méditerranée
163 Avenue de Luminy
13288 Marseille
- France
6
Andromède Océanologie
( 440859 )
- France
7
CNRS -
Centre National de la Recherche Scientifique
( 441569 )
- France
8
IFREMER -
Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer
( 300022 )
- France
9
IRD [France-Ouest] -
Institut de Recherche pour le Développement
( 100685 )
- Centre IRD de Bretagne, Plouzané
- France
10
Zoological Society of London
( 303500 )
- Regent's Park, Londres
- Royaume-Uni
11
UWA -
The University of Western Australia
( 4177 )
- 35 Stirling Highway
Perth WA 6009 Australia
- Australie
12
Lancaster Environment Centre
( 135857 )
- Bailrigg, Lancaster, LA1 4YQ
- Royaume-Uni
13
SPYGEN [Le Bourget-du-Lac]
( 227392 )
- 17 Rue du Lac Saint-André, 73370 Le Bourget-du-Lac
- France
14
ENTROPIE [Réunion] -
Ecologie marine tropicale dans les Océans Pacifique et Indien
( 418794 )
- UNIVERSITE DE LA REUNION
Faculté des Sciences et Technolo
15 Avenue René Casin
BP 92003
97744 ST DENIS CEDEX 9
- France
15
ENTROPIE [Nouvelle-Calédonie] -
Ecologie marine tropicale des océans Pacifique et Indien
( 456389 )
- Centre IRD Nouméa
101 av, Roger Laroque, Anse Vata
BP A5, 98848
Nouméa, Nouvelle-Calédonie
- Nouvelle-Calédonie
16
Fundación Malpelo y Otros Ecosistemas Marinos
( 468534 )
- Carrera 11 No 87-51/Local 4-Piso 2, Bogotá D.C.
- Colombie
17
ITES -
Institute of Terrestrial Ecosystems
( 545455 )
- Universitätstrasse 16, 8092 Zürich
- Suisse
18
POLTEK -
Politeknik Kelautan dan Perikanan Sorong
( 493337 )
- Indonésie
19
Programa de Biodiversidad y Ecosistemas Marino
( 1168099 )
- Colombie
20
UMR ISEM -
Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier
( 1100670 )
- Place E. Bataillon CC 064 34095 Montpellier Cedex 05
- France
21
University of Exeter
( 169802 )
- Mail Room, The Old Library
Prince of Wales Road
Exeter, Devon UK
EX4 4SB
- Royaume-Uni
22
Greenpeace Research Laboratories
( 1168100 )
- Royaume-Uni
23
ECOLAG -
Ecosystèmes lagunaires : organisation biologique et fonctionnement
( 608 )
- Bat. 24, CC 093 Place Eugène Bataillon 34095 MONTPELLIER CEDEX 5
- France
24
UI -
Universitas Indonesia
( 230820 )
- Indonésie
25
Centre of Chemical Safety and Risks, School of the Environment, Nanjing University
( 1089599 )
26
NJU -
Nanjing University
( 305873 )
- Nanjing, Jiangsu Province
- Chine
27
Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research WSL
( 301625 )
- Zürcherstrasse 111, CH-8903 Birmensdorf
- Suisse
|
Licence |
Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
|
Public visé |
Scientifique
|
Langue du document |
Anglais
|
Nom de la revue |
|
Date de publication |
2023-04
|
Vulgarisation |
Non
|
Comité de lecture |
Oui
|
Audience |
Internationale
|
Domaine(s) |
|
DOI | 10.1111/geb.13698 |
Base Horizon | fdi:010088103 |
UT key WOS | 000992663000001 |
Fichier principal
Global Ecology and Biogeography - 2023 - Mathon - The distribution of coastal fish eDNA sequences in the Anthropocene.pdf ( 2.15 Mo
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Origine :
Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte
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